A história do anime se passa em um "Japão feudal futurístico e pós-apocalíptico", onde, aquele que conseguir a bandana simbólica de "Número Um"(o homem mais forte do mundo), irá comandar o mundo, como um "deus". Alguém se torna o Número Um matando o antigo Número Um e tomando sua bandana. Entretanto, somente aquele que tiver a bandana de "Número Dois" tem direito de desafiar o Número Um. Por sua vez somente o número três pode desafiar o número dois, e assim por diante até o número sete, onde todos podem desafiá-lo.

Shotaro é um estudante normal de ensino médio com um comportamento sério. Sakurako é uma mulher extraordinariamente bonita em seus 20 e poucos anos, vem de uma família rica e ama "belos ossos." Os dois vivem na cidade de Asahikawa em Hokkaido, e eles se envolveram em vários incidentes sobre os ossos.

O mangá gira em torno de Kohane Hatoya, uma jovem que gosta de ajudar os outros. Depois que ela se muda do primário para o ensino médio, ela fica fascinada com a torcida, e ela começa um clube de líderes de torcida em sua escola. Juntando-se a Kohane em suas atividades de animadora de torcida está o experiente amigo de infância de Hizume e Kohane, Uki.

Natsumi, Saki, Yuka, e Ringo são melhores amigas. Elas cresceram em uma antiga cidade agrícola, experimentando de tudo juntas, desde felicidades à tristezas. Mas em um verão, eles são visitadas por um milagre.

Juggernauts, os drones não-tripulados de guerra, desenvolvidos pela República de San Magnolia para conter os ataques dos Legion, os drones autônomos do fronteiriço Império de Giad. Mas os Juggernauts são não-tripulados apenas para a mídia. Na realidade, eles são pilotados pelos Eighty-sixers - humanos tratados como inferiores, e usados como meradas ferramentas. Shin é o capitão do Esquadrão Spearhead, lutando num campo de batalha onde apenas a morte o espera. Lena é uma soldada de elite, encarregada das operações de campo e determinada a tratar os Eighty-sixers com humanidade.

O Japão de um futuro próximo sofre um desastre inexplicável. Cinco anos depois, a reconstrução está a caminho. Dois jovem pesquisadores numa universidade estão botando todas as suas esperanças no desenvolvimento robótico.

Ichigo Kurosaki é um garoto de 15 anos que tem uma estranha capacidade de ver, tocar e falar com espíritos de pessoas mortas. Logo que a shinigami Rukia Kuchiki toma conhecimento dos poderes de Ichigo, vai atrás dele para investigar, e acaba em uma luta com um Hollow que foi atraído pelo forte poder espiritual de Ichigo. Antes de ser derrotada pela criatura, Rukia passa seus poderes a Ichigo, o qual se torna um shinigami, e após derrotar o Hollow ingressa em uma jornada para proteger os humanos e os espíritos da ameaça dos Hollows.

A história de Clannad gira em torno de Tomoya Okazaki, um estudante do terceiro ano do ensino médio que não gosta sua vida. A mãe de Tomoya, Atsuko, morreu quando Tomoya era pequeno, deixando seu pai, Naoyuki, para cuidá-lo. Após o acidente, o pai de Tomoya se tornou viciado em álcool e jogo, e criou brigas com seu filho. Um dia, Naoyuki, novamente discutindo com seu filho, empurrou Tomoya contra a parede, deslocando o ombro de seu filho gravemente. Desde então, Tomoya e seu pai passaram a se tratar bem, mas de uma forma distante, como se eles fossem estranhos ao invés de uma família. Isso dói mais em Tomoya do que as antigas brigas com o pai, e o ressentimento de voltar para casa leva Tomoya a ficar constantemente fora de casa a noite toda. Além disso,a lesão no ombro incapacitou Tomoya de participar do seu clube de basquete, e o estimulou a se distanciar de sua escola e de outras atividades. Assim, sua vida de delinquente se inicia. O melhor amigo de Tomoya, Youhei Sunohara, que foi expulso do clube de futebol por uma briga, também é um delinquente e,muitas vezes fica em seu dormitório com Tomoya sem fazer nada. A história começa na segunda-feira 14 de abril de 2003, no início do ano letivo, quando Tomoya encontra por acaso Nagisa Furukawa, uma garota de fala suave um ano mais velha que ele, que está repetindo o ano escolar por ter ficado muito doente no ano anterior. Seu objetivo é participar do clube de teatro para o qual ela não pode entrar devido à sua doença, mas eles descobrem que o clube de teatro foi fechado depois que os membros remanescentes se formaram. Como Tomoya tem muito tempo para livre, ele decide ajudar Nagisa a retomar o clube de teatro. Durante esse tempo, Tomoya faz amizade com várias outras garotas e começa a conhece-las mais profundamente, ajudando-as com seus problemas individuais.

Uma série conta a história de uma menina gatinho vestindo roupas de lolita gótica chamada Cyan que é abordada por Arisugawa, o presidente de uma agência de música. Lá, ela conhece Chuchu (um trocadilho com o som que os coelhos fazem) a menina coelho estudante da honra, uma menina cão chamada Retoree (de “Retriever”), e uma ovelha alienígena chamada Moa. Juntas, elas formam a banda “Plasmagica”, e tentam alcançar o topo do mundo. No entanto, o caminho é longo e difícil, e manter um alto astral é importante. Ao lutar contra outras bandas estranhas, Plasmagica cresce lentamente em direção a uma banda de topo.

True Tears conta a história de um estudante chamado Shinichiro com muitas capacidades artísticas. Ele vive com a sua mãe, pai e com Hiromi Yuasa, que passou a viver na casa de Shinichiro desde que o pai dela morreu. Em casa Hiromi actua de uma forma fria mas Shinichiro não tem coragem de falar com ela. Na escola, Hiromi é popular, e é talentosa nos esportes, mas Shinichiro sabe que ela esconde algumas coisas e que as mantém apenas para si mesma. Shinichiro conhece uma estranha garota na escola chamada Noe Isurugi que lhe deseja má sorte na vida. Depois de ter má sorte com algumas coisas, ele reconcilia-se com Noe e descobre que ela "abriu mão de suas lágrimas".

Quando Riki era criança, seus pais morreram, deixando-o depressivo e sem esperanças. O que o salvou foi um grupo de quatro crianças que se auto-denominam "Little Busters". Eles pegaram Riki e brincaram com ele durante seus tempos de necessidade. Ele adorava passar o tempo com eles, então a sua dor foi sumindo com o tempo. Agora, Riki já está em seu segundo ano do colegial, e Kyousuke, o “líder” do grupo, está prestes a finalizar a escola (que todos frequentam juntos), o grupo de amigos se depara com uma separação iminente, e que nada dura para sempre… Com isso, eles decidem fazer algo para se lembrar dos velhos tempos: jogar beisebol juntos; enquanto desejam que a vida, como ela está agora, pudesse continuar eternamente… Little Busters! faz nos relembrar/repensar a nossa adolescência de maneira espetacular. Numa mistura de muito bom humor, onde os amigos fazem “idiotices” pelo bem da diversão, e um drama para derramar lágrimas.